非淋菌性尿道炎有两个特点：发病慢，症状轻。医院在不洁性交后，要经过1-3周的潜伏期才出现非淋菌性尿道炎的症状，而不像淋病那样，呆需2-5天就出现症状。

　　其次非淋菌性尿道炎的症状较淋病要轻，医院在男性典型表现为尿道有刺痛或烧灼感，伴有轻至中度的尿急、尿痛及排尿困难。男性主要的合并症是附睾丸炎，患者的附睾肿胀触之疼痛。附睾炎常为单侧性，有时同侧的睾丸亦发生炎症，阴囊肿胀疼痛。炎症使输精管增粗，如不及时治疗，那么反复发作可因炎症发生纤维化，导致输卵管堵塞。若双侧堵塞可造成男性不育。